SMA Negeri 11 Kupang resmi didirikan pada tanggal 1 Desember 2011 sebagai jawaban atas kebutuhan mendesak akan institusi pendidikan berkualitas di wilayah Alak.
Berawal dari semangat para tokoh masyarakat dan pemerintah daerah untuk memperluas akses pendidikan, sekolah ini mulai beroperasi dengan fasilitas yang sangat terbatas namun dengan dedikasi tenaga pendidik yang luar biasa.
Seiring berjalannya waktu, sekolah ini terus mengalami perkembangan pesat, baik dari segi infrastruktur maupun prestasi siswa, menjadikannya salah satu sekolah yang diperhitungkan di Kota Kupang.